学院现设有8个县级机构，1所专家门诊、1家藏药厂、1个采认药基地和2所教学医院、1所非直属附属医院、1个非直属教学药厂。全院教职工145人，其中专兼职教师66人，高级技术职称13人，中级技术职称33人；研究生导师24人。在校生1028人，其中博士研究生2人、硕士研究生34人，本专科生844人，成人教育148人。
    作为全国唯一有权授予藏医硕士学位的高校，经过多年的发展，形成了一批优势和特色学科。目前拥有本专科专业4个（藏医本科、藏药本科、藏医专科、天文星算专科）；1个藏医硕士授予点，1个国家中医药管理局重点学科——藏药（生药）学，1个中央与地方共建高校基础实验室，1个省部共建重点实验室。

    西藏藏医学院注重发挥专业优势，致力于藏医药科学研究，科技开发，先后承担并完成了国家级科研项目9项，省部级8项，其中1项成果获藏医药国际学术大会金奖，1项成果获国家科技进步二等奖， 1项成果获国家教学成果二等奖，有近10项科研成果得到转化，部分产品远销海外。目前承担包括“863”项目在内的国家科研项目14项；省部级项目6项。

    学院专家门诊藏医药专科专病特色突出，诊疗技术水平较高，深受患者欢迎；学院藏药厂2004年通过GMP认证，现生产藏药品种达64种，其中24种药品获得国家批准文号，7个品种被列入国家中药保护品种，3个产品被评为自治区名优产品，2个品种被评为国家技术创新优秀产品，列入“全国重点科技项目计划”和“国家级火炬计划项目”。
    学院积极开展对外合作与交流，与北京中医药大学、上海中医药大学、广州中医药大学、成都中医药大学、天津大学、江西中医学院、新疆维医专科学校等高校建立了合作关系。派遣专家先后赴港澳台和美国、英国、德国、瑞士、日本、巴西、意大利、俄罗斯、匈牙利等24个国家进行讲学；先后给30多个国家和地区的学者讲授藏医药学知识，特别是1994年在英国开办了藏医班，给11个国家的45名医生授课，扩大了藏医药学的影响，为藏医药学走向世界奠定了基础。

    回首过去，硕果累累。建院17年，学院共为西藏、青海、甘肃、四川、云南、新疆、内蒙等省区培养和输送了各级各类藏医药专业人员1100多人；编写了藏医药历史上第一也是唯一的《藏医专业本科教学大纲》；编写了世界上第一套藏医本科现代教学专用教材、第一套藏药专业本科教学试用教材；培养了世界上第一个藏医专业本科、第一个藏药专业专科、第一个藏药专业本科、第一个藏医专业成人专科和天文星算专科学生；培养了世界上首批藏医专业硕士研究生；与北京中医药大学以联合培养的形式，招收了世界上首批藏医博士研究生。

    展望未来，任重道远。学院将继续坚持以藏医药教育为主，以教学为中心，以科研促进教学，以医疗保障教学，以产业服务教学，产学研协调发展。秉承传统，开拓创新。全面贯彻党的教育方针，深化教学改革，不断提高教育质量和办学层次，为振兴藏医药事业做出更大贡献。